Merikarvianjoki on yksi eteläisen Suomen laajimmista ja suosituimmista koskikalastuskohteista. Joki on tunnettu kauniista jokiluonnostaan ja lukuisista koskistaan.
Merikarvianjoen luontaiseen kalakantaan kuuluvat mm. meritaimen, lohi, hauki, ahven ja siika. Kalakantaa ylläpidetään istuttamalla jokeen meritaimenta, harjusta, lohta ja kirjolohta. Kaikki Suomen jokikutuiset lohikalat lisääntyvät luontaisesti Merikarvianjoessa.
Meritaimenella, lohella ja vaellussiialla on merestä jokeen vapaa nousu 24 km pitkälle kalastusalueelle. Merikarvianjoki on maamme ensimmäinen vaelluskalajoki, jonka suualueelle on perustettu vapaaehtoisesti laaja, viiden kilometrin päähän avomerelle ulottuva verkkokalastuskieltoalue. Tämä takaa kaloille esteettömän nousun Merikarvianjokeen. Nousukalat eivät täällä törmää jokisuissa tavallisesti oleviin lukemattomiin verkkoihin ja rysiin.
Kovalla pitkäjänteisellä kalavedenhoitotyöllä on onnistuttu palauttamaan merilohen ja meritaimenen luontainen lisääntyminen Merikarvianjokeen. Kalakantojen hoidossa pyritään edistämään joen luontaista kalantuotantoa niin kalastussäädöksin kuin hoitotoimin. Kunnostetuille koskialueille istutetaan lohikalojen poikasia. Luontaisia kalakantoja tuetaan kalastuspaineen vuoksi tuki-istutuksilla.